論文

Amano, K., Haga, T., Sato, T., Hamuro, T. and Hamuro, M. Middle Miocene climatic transition in the Japan Sea borderland of Honshu—Middle Miocene molluscan fauna from Unazukimachi-Orirate in Kurobe City, Toyama Prefecture, Japan—. Bulletin of the Mizunami Fossil Museum, 52(1), in press.
Amano, K., Lutaenko, K. A. & Haga, T. 2024. Taxonomy, reproduction, and evolution of the small carditid Miodontiscus (Bivalvia) in the northern Pacific. The Nautilus, 138(3-4): 59-74.

New taxon described in this work:
Miodontiscus popovi Amano, Lutaenko & Haga, 2024
中野智之・古川邦之・芳賀拓真・福田 宏. 2021. マルタニシの「自動脱殻」. Molluscan Diversity, 6(1): 39–42 (in Japanese with an English abstract).
南波紀昭・向峯 遼・芳賀拓真・佐伯いく代. 2020. 筑波大学筑波キャンパスの陸産・淡水産貝類相. ちりぼたん, 50(2): 221–240. [Namba, N., Mukaimine, W., Haga, T. & Saeki, I. 2020. Terrestrial and freshwater mollusks on the University of Tsukuba Campus, Tsukuba City, Japan. Chiribotan, 50(2): 221–240 (in Japanese with an English abstract).]
山崎友資・野別貴博・芳賀拓真・千葉 晋・園田  武. 2015. ロシア国サハリン州サハリン島から確認された貝類: 特にカモメオオノガイ (新称) とチヂレカモメガイ (新称) について. ちりぼたん, 45(4): 262–283. [Yamazaki, T., Nobetsu, T., Haga, T., Chiba, S. & Sonoda, T. 2015. Mollusks in Sakhalin Island, Russia, with special notes on the occurrence of Mya (Arenomya) baxteri Coan & Scott, 1997 and Zirfaea crispata (Linnaeus, 1758). Chiribotan, 45(4): 262–283 (in Japanese).] 
亀田勇一・芳賀拓真・湊 宏. 2013. 石川県七尾西湾沿岸から発見されたクビキレガイモドキ (腹足綱: リソツボ上科: イツマデガイ科). Molluscan Diversity, 3(2): 59–63. [Kameda, Y., Haga, T. & Minato, H. 2013. New records of Cecina manchurica Adams, 1861 (Gastropoda: Rissoidea: Pomatiopsidae) from the coasts of Nanao West Bay, Ishikawa Prefecture, Japan. Molluscan Diversity, 3(2): 59–63 (in Japanese with English abstract).]
Kase, T., Nakano, T., Kurihara, Y. & Haga, T. 2013. A Middle Pleistocene limpet assemblages from central Japan (Gastropoda: Patellogastropoda) and selective extinction of intertidal rocky shore molluscs in response to glacio-eustatic sea-level changes. Paleontological Research, 17(3): 261–28
芳賀拓真・乾 睦子. 2013. 貝の化石を探そう: 地学の教育実践から. 月刊地理, 58(699): 51–59. [Haga, T. & Inui, M. 2013. Trying to find molluscan fossils –an educational practice in geology– (trans. auct.). Gekkan-chiri, 58(699): 51–59 (in Japanese).]
芳賀拓真. 2013. 幼貝? それとも雄? —深海に沈んだ木に棲息するキクイガイ科二枚貝類の生殖様式. うみうし通信,78: 7–9. [Haga, T. 2013. Juvenile, or a male? The reproductive pattern of deep-sea wood-boring bivalve Xylophagaidae (trans. auct.). Umiushi-Tsushin, 78: 7–9 (in Japanese).]
佐藤慎一・芳賀拓真・山下博由. 2013. シャミセンガイ腕足類に付着するウロコガイ上科二枚貝シャミセンヒキの属特異的共生 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 3(2): 112–113. (in Japanese)
芳賀拓真. 2013. クチキレエビス科 Satondella属 (腹足綱) の再検討 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 3(2): 99–101. (in Japanese)
芳賀拓真. 2013. クチキレエビス科 Satondella属 (腹足綱) の再検討 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 3(2): 99–101. (in Japanese)
芳賀拓真・平 宗雄・竹谷陽二郎・二上文彦・加瀬友喜. 2012. 相馬中村層群の上部
ジュラ系から産出した世界最古級のニオガイ上科穿孔性二枚貝 Opertochasma somaensis (オオノガイ目) の産出 [レビュー]. 福島県立博物館研究紀要, 26: 21–33. [Haga, T., Taira, M., Taketani, Y., Futakami, F. & Kase, T. 2012. Review –The occurrence of one of the oldest pholadoidean boring bivalves, Opertochasma somaensis (Order Myoida), from the Upper Jurassic of the Somanakamura Group, Northeast Japan. Bulletin of the Fukushima Museum, 26: 21–33 (in Japanese with English abstract).]
芳賀拓真. 2011. 熱帯北オーストラリア産 Lentidium 属の2新種 (オオノガイ目: シコロクチベニガイ科): 注目すべき淡水〜汽水棲の二枚貝類 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 3(1): 25–27. (in Japanese)
氏野 優・芳賀拓真・多留聖典. 2011. ダイオウナミノコ Donax scortum (Dance, 1982) の砂排出 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 3(1): 24. (in Japanese)
Yamashita, H., Haga, T. & Lützen, J. 2011. The Bivalve Divariscintilla nipponica n. sp. (Heterodonta: Galeommatidae) from Japan, a commensal with a mantis shrimp. Venus, 69(3–4): 123–133.
芳賀拓真. 2010. アジア淡水域へのイガイ科二枚貝の進出 — カンボジア産 Sinomytilus harmandiLimnoperna fortunei カワヒバリガイの比較 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 2(2): 69–70. (in Japanese)
緒方大地・飯田 茜・中島美貴・山崎愛柚香・園原哲司・多々良有紀・芳賀拓真. 2010.
外来水棲腹足類コモチカワツボ (新生腹足類:リソツボ上科) における日本初の雄性個体の発見ならびに新産地. Molluscan Diversity, 2(2): 60–68.
芳賀拓真. 2010. 淡水性二枚貝カワホトトギス Dreissena polymorpha (Pallas, 1771) の晶桿体及び消化盲嚢におけるアミロース分解活性とセルロース分解活性 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 2(1): 28.
芳賀拓真. 2010. イシゴロモ (二枚貝綱: オオノガイ目: ニオガイ科) の分布の現状. Molluscan Diversity, 2(1): 1–6. [Haga, T. 2010. The distribution of the pholadid Aspidopholas yoshimurai (Bivalvia: Myoida) in Japan. Molluscan Diversity, 2(1): 1–6 (in Japanese with English abstract).]
芳賀拓真. 2009. 相模湾真鶴岬及び沖縄産のクチキレエビスガイ科・スカシエビスガイ科 (腹足綱: 古腹足上目) の新種 [論文抄訳]. Molluscan Diversity, 1(1): 18–21. (in Japanese)
Okutani, T., Saito, H. & Haga, T. 2009. Shelf to Bathyal Bivalve and Scaphopod Mollusks Collected by the R/V Wakataka-maru from off Pacific Coast of Northern Japan during the Years 2005–2007. Deep-sea Fauna and Pollutants off Pacific Coast of Northern Japan, National Museum of Nature and Science, Monographs, 39: 193–223.
中野智之・芳賀拓真・染谷さやか. 2009. ヤヨイハナガサの幼貝. ちりぼたん, 39(2): 63–65. [Nakano, T., Haga, T. & Someya, S. 2009. Juveniles of Yayoiacmea oyamai (Patellogastropoda: Lottiidae). Chiribotan, 39(2): 63–65 (in Japanese with English abstract).]
芳賀拓真・福田 宏・山下博由. 2008. 2006年度春季例会 (内房) 報告. 山口貝類研究
談話会ニュースレター
, 6–12: 23–29. (in Japanese)
芳賀拓真. 2008. 千葉県館山湾での12年の採集を振り返る. ひたちおび, 109: 8–18. (in Japanese)
芳賀拓真. 2006. 海外でのモラスカ野外調査の最前線 —Panglao Marine Biodiversity Project 2004 を例に—. ひたちおび 104: 9–17. (in Japanese)
Sarashina, I., Yamaguchi, H., Haga, T., Chiba, S. & Endo, K. 2006. Molecular Evolution and Functionally Important Structure of Molluscan Dermatopontin: Implication for the Origins of Mollusca Shell Matrix Proteins. Journal of Molecular Evolution, 62(3): 307–318.
奥山康子・坂野靖行・青木正博・中島 礼・芳賀拓真・利光誠一・兼子尚知・中澤 努. 2005. 地球なんでも相談. 地質ニュース, 607: 64–65. (in Japanese)
芳賀拓真. 2001. グンバイフナクイムシ類2種の最北端分布記録. ちりぼたん, 32(1/2): 16–18. [Haga, T. 2001. Northernmost record of two Teredothyra species from off Ibaraki Prefecture, Eastern Japan. Chiribotan, 32(1/2): 16–18 (in Japanese with English abstract).]
芳賀拓真. 2000. 茨城県沖から沈木に付着して採集された腹足類. うみうし通信, 29: 7–8. [Haga, T. 2000. Gastropod mollusks collected associated with sunken woods off Ibaraki Prefecture. Umiushi-tsushin, 29: 7–8 (in Japanese).]