役職員
| 館長 | 篠田 謙一 | |
| 理事（兼）副館長 | 栗原 祐司 | |
| 監事 | 髙山 昌茂 | |
| 監事 | 池田 千絵 | |
| 研究調整役（兼）副館長 | 細矢 剛 | |
| 経営管理部長 | 澁谷 仁 | |
| 経営管理部 | 総務課長 | 高橋 鮎太 |
| 経営管理部 | 財務課長 | 田口 大介 |
| 経営管理部 | 研究推進・管理課長 | 菅 圭之介 |
| 経営管理部 | 施設整備主幹 | 北條 勝 |
| 経営管理部 | 情報化推進室長 | 濱田 浄人 |
| 展示部長 | 小松 孝彰 | |
| 展示部 | 常設展示・巡回展示課長 | 田邊 玲奈 |
| 展示部 | 企画展示課長 | 野村 篤志 |
| 学習支援部長 | 光石 恭典 | |
| 学習支援部参与（兼） | 濱田 浄人 | |
| 学習支援部 | 学習課長 | 濱村 伸治 |
| 学習支援部 | 広報・連携課長 | 関根 則幸 |
| 科学系博物館イノベーションセンター長 | 有田 寛之 | |
| 科学系博物館イノベーションセンター | マーケティング・コンテンツグループ長 | 倉島 治 |
| 動物研究部長 | 藤田 敏彦 | |
| 動物研究部 | 脊椎動物研究グループ長 | 篠原 現人 |
| 動物研究部 | 海生無脊椎動物研究グループ長 | 齋藤 寛 |
| 動物研究部 | 陸生無脊椎動物研究グループ長 | 野村 周平 |
| 植物研究部長（兼） | 細矢 剛 | |
| 植物研究部 | 陸上植物研究グループ長 | 田中 伸幸 |
| 植物研究部 | 菌類・藻類研究グループ長 | 大村 嘉人 |
| 植物研究部 | 多様性解析・保全グループ長 | 國府方 吾郎 |
| 生命史研究部長 | 甲能 直樹 | |
| 生命史研究部 | 進化古生物研究グループ長 | 矢部 淳 |
| 生命史研究部 | 環境変動史研究グループ長 | 重田 康成 |
| 生命史研究部 | 人類史研究グループ長 | 坂上 和弘 |
| 理学研究部長 | 佐野 貴司 | |
| 理学研究部 | 地学研究グループ長 | 谷 健一郎 |
| 理学研究部 | 理化学グループ長 | 室谷 智子 |
| 筑波実験植物園長 | 遊川 知久 | |
| 昭和記念筑波研究資料館長（兼） | 藤田 敏彦 | |
| 附属自然教育園長（兼） | 篠田 謙一 | |
| 附属自然教育園事務長（兼） | 澁谷 仁 | |
| 産業技術史資料情報センター長 | 前島 正裕 | |
| 産業技術史資料情報センター | 科学技術史グループ長 | 沓名 貴彦 |
| 標本資料センターコレクションディレクター（兼） | 細矢 剛 | |
| 標本資料センター副コレクションディレクター | 神保 宇嗣 | |
| 分子生物多様性研究資料センター長（兼） | 細矢 剛 | |
| 分子生物多様性研究資料センター副センター長（兼） | 神保 宇嗣 | |
| 監査室長（兼） | 澁谷 仁 | |
注：（兼）は兼務（2025年4月1日現在）