原生生物（プロティスト）、細胞内共生/寄生、比較ゲノム、オルガネラ進化

原生生物というほとんどが顕微鏡でしか見えない生物を研究しています。特に共生や寄生などの２つ以上の生物の相互作用がどのように進化してきたのか、ゲノムレベルの遺伝情報を用いて研究しています。近年の研究により、原生生物はこれまでに認識されていたよりも巨大な多様性をもっていることが明らかになっており、分子から生態レベルでの「謎」がまだまだ詰まっています。