チャツボボヤは普通のホヤ類と異なり,体内にいる原核緑藻類という共生藻が光合成のために光を必要とするので,サンゴ礁の太陽がさんさんとふりそそぐ岩の表面などで生活している変わり者である. チャツボボヤは原核緑藻類から栄養をもらって生活しているが,ホヤ本来のえさの取り方もできるので原核緑藻類を失ってもある程度生きていける.しかし,原核緑藻類はチャツボボヤを離れては生きていけないといわれている.