MRCのコレクション以外の微化石の標本については、地学研究部の微化石コレクション(MPC)に収められています。これらは、当館の 標本・資料統合データベースの「微化石」から検索することが出来ます。
また、微化石と現生微細藻類の両方を研究された奥野春雄氏の標本資料については、植物研究部の 微細藻類標本庫に収められています。